Estradas
Duas rodovias federais ligam Cuiabá ao Norte e Sul do Brasil: a BR-163 (Cuiabá-Santarém, no Pará) e BR-364 (Campo Grande, Mato Grosso do Sul-Cuiabá). Totalmente pavimentadas, as duas rodovias estão em bom estado de conservação e, em alguns trechos, está duplicada.
Para chegar a Chapada dos Guimarães, a via mais utilizada é a MT-251, que liga Cuiabá àquela cidade (64 km). A rodovia é pavimentada, cheia de curvas e em alguns trechos está duplicada.
Para chegar a Nobres, há duas alternativas: pela BR-163, partindo de Cuiabá (total de 190 km), ou pela MT-351 (150 km), até o Distrito de Bom Jardim, onde estão as principais atrações turísticas.
Para chegar a Poconé, é preciso andar 11 km pela BR-070 até o entroncamento com a MT-060. De lá, são mais 100 km até chegar à Transpantaneira e ao pantanal propriamente dito.
Aeroportos
O principal aeroporto de Mato Grosso fica em Várzea Grande, cidade vizinha a Cuiabá. O Aeroporto Marechal Rondon tem pista de 2.300 metros, um terminal de passageiros de 9.354 m2 e capacidade para 4 milhões de passageiros/ano, além de um estacionamento com 420 vagas.
Outro aeroporto bem estruturado e que deve receber melhorias é o de Cáceres, que também tem capacidade para aeronaves de grande porte. Sem sinalização noturna.
Já Chapada dos Guimarães e Poconé têm aeroportos sem pavimentação e iluminação, permitindo a utilização de aeronaves de pequeno porte.